木耳菌丝体是由无色透明，具有横隔和分枝的管状菌丝组成。菌丝在基质中吸收养料，在树皮下形成扇状菌丝体。
木耳子实体薄而有弹性、胶质、半透明，中凹，常常呈耳状或环状，渐变为叶状。基部狭窄成耳根，表面光滑，或有脉络状的皱纹，直径一般4厘米~10厘米，大的可达12厘米以上。干后强烈收缩，上表面子实层变为深褐色至近黑色，下表面呈暗灰褐色，布满极短的绒毛。
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